search
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בדקת לפי היחס בנפחים של הדיפרוטונייטד חלקי הפרוטונייטד
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ריכוז של 1 הוא למעשה 10 בחזקת 0 כששמים בלוג זה יוצא 0
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
זאת משום שבנקודה זו תורם הפרוטון ומקבל הפרוטון זהים ובנקודה זו PH התמיסה ישתנה הכי פחות עבור כל תוספת פרוטון או הידרוקסיד והשינוי הזה יהיה זניח ביחס לשניוי שנקבל לאחר הוספת פרוטון או הידרוקסיד למים טהורים או לתמיסה עם מלח של חומצה חזקה או בסיס חזק לו אין בכלל באפרינג פאוור
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
עבור חומצה חזקה pKa נמוך ו- Ka גבוה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
עבור חומצה חזקה pKa נמוך ו- Ka גבוה ולהפך
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ניתן למדוד את המוליכות של המים. מים טהורים מייצרים זרם חשמלי כאשר היון הידרוקסיל נע לכיוון האנודה (חיובית). תנועת ההידרוקסיל וההידרוניום מהירה ביותר בהשוואה לתנועת יונים כמו אשלגן או כלור. הפרוטונים לא נעים לבד אלא קופצים בין קשרי המימן של המים. קבוצת ההידרוקסיד נעה הפוך למשל בתמונה מלמטה למעלה לכיוון האנודה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
עלייה באנטרופיה של המים שווה לעלייה באנטרופיה של כל המערכת כי המים מכילים את המערכת
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
מי יהיה למעלה ומי יהיה למטה תלוי בצפיפות של החומר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
אפקט הידרופובי הוא מצב שבו המולקולות ההידרופוביות בורחות מהמים ויוצרות פאזה חדשה למשל
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
חומר הידרופילי הוא פולארי בהגדרה (לא בהכרח טעון)
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
למשל מח שולחן המתפרק ל- 2 יונים פי 2 יותר ממולקולת גלוקוז, כך שמסה של 1 מול מלח במים נותנת לחץ אוסמוטי שהוא כפול פי 2 מזה של 1 מול גלוקוז. זו לא תכונה של החומר אלא כממות החלקיקים במומס שנותנת את התכונות הקוליגטיביות
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
מומסים מכל הסוגים משפיעים ומשנים את תכונות הממס. תכונות פיזיקליות של הממס מושפעות מהמומס ללא קשר לתכונות המומס אלא רק לריכוזו - תכונות אלה נקראות קוליגטיביות - לחץ אידוי, נקודת רתיחה, נקודת התכה= נקודת קיפאון, לחץ אוסמוטי. מה שמשותף לארבעת תכונות אלה הוא שהן נובעות מכך שריכוז המים בתמיסה יורד. התכונות הללו לא קשורות לתכונות המומסים עצמם אלא רק לריכוז המומסים או יותר נכון לכמות החלקיקים של המומסים בתוך כמות מסוימת של מים
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בגלל שהשפעת המומס על האוסמולריות תלוייה במספר החלקיקים המומסים ולא במסה שלהם, מאקרומולקולות כמו חלבונים ופוליסכרידים, הן בעלו אפקט נמוך בהרבה על האוסמולריות מאשר מסה שווה של הרכיבים המונומרים שלהם.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
לחץ אוסמוטי מוגדר ככח הנדרש כדי להתנגד למעבר המים דרך הממברנה ומיוצר על ידי האות פאי
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
מדור בו ריכוז החלקיקים גבוה יותר הוא דווקא מקום בו ריכוז המים נמוך יותר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כדי להפריד ביניהן, כל האינטראקציות צריכות להיות מופרעות באותו הזמן, אך מאחר שהאינטראקציות הלא קובלנטיות הן פללוקטאטיביות (מתנתקות ומתחברות כל הזמן) הפרעה שכזו המתרחשת בו זמנית איננה מתקבלת על הדעתץ לכן 5 או 20 אינטראקציות חלשות יוצרות יציבות מולקולרית גדולה יותר מאשר סכימה פשוטה של אנרגיית הקישור - כלומר קיימת סינרגיה של אנרגיית הקישור.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
את יציבות האינטראקציות ניתן לחשב בעזרת אנרגיית הקישור, הירידה באנרגיה של המערכת כאשר יש קישור בין שני שותפים (מולקולה קטנה למאקרומולקולה) יציבות הניתנת לחישוב מקבוע שיווי המשקל של ריאקציית הקישור בין המולקולה הקטנה למאקרומולקולה, משתנה באופן אקספוננציאלי עם אנרגיית הקישור
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
למשל אינטראקציה של אנזים עם סובסטראט מצריכה מספר אינטראקציות מימן וקשר יוני אחד או יותר ועוד מספר אינטראקציות הידרופוביות וקשרי לונדון (ו.ד.ו) ההופעה של כל אחד מהקשרים החלשים הללו תורמת לאינטראקציה חזקה יחסית ולירידה באנרגיה החופשית של המערכת.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
=משותף
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
אמנם המבנה שמולקולות המים תופסות במצב שנכנס הידרופובי פחות מאורגן ממברנה הקריסטלין (כעת הכלוב ייקרא clathrate) אבל האפקט יהיה זהה - התארגנות מולקולות למצב מאורגן וגודל הירידה באנטרופיה הנובע מהמספר הזה נמצא בקורלציה לפני השטח של המולקולה ההידרופובית הנמצאת בכלוב המים. מאחר שגם ההפרש באנתלפיה חיובי וגם ההפרש באנטרופיה שלילי ההפרש באנרגיה החופשית יהיה חיובי
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
השילוב של הירידה באנטרופיה והעובדה שהגזים אינם יוצרים אינטראקציה עם המים מאחר ואינם פולאריים מובילה לנטייה ירודה שלהם להתמוסס במים.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
המים כאמור הם ממס פולארי וככזה מתמוססים בו מרבית המולקולות הביולוגיות. כאשר מלח שולחן מתמוסס במים, יוני הנתרן והכלור מתנקים מהמבנה הקריסטלי המסודר ומקבלים דרגת חופש גבוהה יותר של תנועה מה שמוביל לעלייה באנטרופיה של המערכת כולה כך שהכוח התרמודינמי האחראי להמסת המלח הינו עלייה באנטרופיה.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
קשרי המימן ארוכים יותר וחלשים יותר מהקשר הקובלנטי אורך קובלנטי - 0.0965 ננו מטר אורך מימן - 0.177 ננומטר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
חום נלקח ע"י המערכת (עלייה באנתלפיה) אך ישנה גם עלייה באנטרופיה של המערכת מאחר והרשת המסודרת של המים מתפרקת והופכת להיות פחות מסודרת הן במעבר מקרח למים נוזליים והן במעבר ממים נוזליים לאדי מים.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
במצב צבירה נוזלי מתקבצות מולקולות המים למעין צברים זמניים בעלי זמן חיים קצר המקושרים בינים על ידי קשרי מימן שנוצרים ומתפרקים הם קיבלו את השם flickering clusters
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בתמיסה יש יותר מים ולכן אם האנטרופיה של המים עולה , אז האנטרופיה של כל המערכת עולה.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כשלוקחים מולקולות הידרופוביות בודדות המים יורדים כיביכול באנטרופיה, ברגע שהאזורים ההידרופובים מתחילים להיפגש אחד עם השני נחסכת פעולת ההסתדרות בצורת כלוב מהרבה מולקולות מים. ואז האנטרופיה עולה כי רמת אי הסדר או המצבים בהם ניתן למצוא אותן הם גבוהים יותר. לכן מה שמניע את תופעת המיצלות הוא עלייה באנטרופיה של המים וכתוצאה מכך של כל המערכת. המיצלה היא אמנם מבנה סופר מסודר, אז לכאורה נשאלת השאלה איך זה עלייה בבלאגן? הפתרון הוא שיש עלייה בבלאגן של המים כי למים יותר מצבי סידור אפשריים.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
יש לקשרי מימן להסתדר בזוית של 180 מעלות בין אטומי הנוף. לא תמיד הם ב- 180 אבל אם הם כן זה הרבה יותר יציב - מסביר את תופעת האנומליה של המים. כל חומר שנקרר ילך ויתכווץ יש התקרבות של המולקולות והנפח קטן. מים - בטמפ בין 4 למינוס 4 מעלות צלסיוס בדיוק במעבר מנול למוצק והם עוברים מלעשות 3.4 קשרי מימן ל- במוצק. כלומר הן כולם מתחילות להתסדר ב- 180 מעלות למצורה של קריסטלואיד/ קריסטלין : מולקולה נוספת שעושה זאת היא אמוניה NH3 בטווח טמפ אחר. וכך למעשה נפח המים במצב מוצק גדול מנפח המים במצב נוזלי
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
לשים לב שכאשר ההפרש חיובי הדלתא ג'י שלילי
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
נחשב פוטנציאל רידוקס כך: מה שכתוב בצד הנכון בטבלה (שיהיה תמיד תגובת חיזור) פחות מה שכתוב בצד הלא נכון בטבלה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
מתח הוא למעשה פוטנציאל, כלומר הוא יתממש וייתן אנרגיה רק אם ניתן לו תווך, כמו חוט תיל או אנזימים
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כאשר מדובר בפרוקסידים כמו מי חמצן לכל חמצן יהיה מספר חמצון שהוא מינוס 1
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
למשל במולקולת מים החמצן לקח אלקטרון אחד מכל מימן ולכן מספר החמצון שלו יהיה מינוס 2, לעומתו על מימן יחסר אלקטרון ויקבל מספר חמצון +1
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כותבים תכלס E והוא פירוש של דלתא אפסילון
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ככל שהפרשי הרידוקס יותר גדול, כלומר ככל שהמתח ביניהם יותר גדול, ככה ניתן להפיק יותר אנרגיה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
action ratio mass - היחס בין התוצרים למגיבים (כל אחד במשוואה יועלה בחזקה של המקדם הסטויכומטרי שלו) במצבים השונים משיווי משקל - מכונה Q מנת הריאקציה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
לא נוכל להשתמש בגלל סיבה זו בדלתא ג'י של ריאקציה להערכת ספונטניות, אלא אם נאמר לנו מהם הריכוזים של המגיבים והתוצרים. מסיבה זו בספרי הנתונים של הכימאים מופיע ערך שונה בתנאים סטנדרטיים מוגדרים
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
הסיבה שדלתא ג'י משתנה היא שככל שהריאקציה מתקדמת ריכוזי המגיבים הולכים ויורדים , לכן האנרגיה בכל רגע נתון המתקבלת מההתנגשויות של המגיבים יורדת, ומתחילים להיווצר תוצרים שמתחילים להתנגש אחד עם השני וליצור ריאקציה בכיוון ההפוך. מנת הריאקציה Q מתחילה מאוד נמוכה כשיש רק מגיבים והולכת ועולה במקביל עד שמשתווה לקבוע שוומ
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
במצב של דלתא ג'י חיובי - הריאקציה בכיוון ההפוך ספונטנית אם דלתא ג'י הוא 0 הריאקציה במצב של שוומ המטרה של כל מערכת היא לרדת ככל הניתן ברמת האנרגיה. מצב יציב - אין שינוי בריכוזים, אך ישנה השקעת אנרגיה על מנת לשמר את המצב דלתא ג'י לא שווה ל- 0 שוומ - אין שינוי בריכוזי התוצרים והמגיבים = אין אנרגיה, דלתא ג'י =0
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
קינטיקה: תאוריה נפרדת מהתרמודינמיקה ומתייחסת לקצב הריאקציה שנגזר מריכוז המגיבים מסדר הריאקציה (הקשור למנגנון) ולאנרגיית האקטיבציה, התרמודינמיקה: מתייחסת לספונטניות של הריאקציה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
אנזים למרות יכולתו לזרז את קצב התגובה, לא ישנה את קבוע השוו"מ שלה. זוהי נקודה חשובההה מאודדדד
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בגרף מימין, כיוון שחימום המערכת לטמפ' גבוהות לא בא בחשבון בתאים חיים האנזימים מייצבים מצבי ביניים שונים וכך מקטינים את אנרגיית האקטיבציה. חשוב להבין שהשינוי באנרגיה החופשית של המערכת לאחר תגובה הוא זהה בין אם התגובה התרחשה באופן ספונטני עם אנרגיית אקטיבציה גבוהה או שזורזה על ידי אנזים. השינוי באנרגיה החופשית תלוי רק בריכוזי המגיבים והתוצרים בשוו"מ ובטמ"פ של המערכת
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
עץ יהיה יציב יותר (מועדף יותר מבחינה תרמודינמית) כאשר יפורק לפדח ולמים אך למה הם אינם ניצתים באופן טבעי? כנראה בגלל אנרגיית האקטיבציה חיובית מאוד. ברגע שתסופק אנרגיית האקטיבציה למשל בצורת גפרור, האנרגיה שתתקבל מבעירת נקודה מסוימת בעץ תספיק לשפעול תהליך זה בסביבה קרובה לנקודה ו וכך התהליך ימשיך עד בעירה מוחלטת או עד לעצירת התהליך.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
הקרטריון לספונטניות הוא דלתא G שלילי ולא התנאים הסטנדרטיים. אם נשמור על ריכוז נמוך של התוצרים מנת התגובה תהיה קטנה מ- 1 ותתקבל תוצאה שלילית ב- ln וכך התגובה תתקדם קדימה. חלק מהאנרגיה תמיד אובד לצורך הגדלת האנטרופיה וכמות האנרגיה שמופקת מהתגובה תמיד תהיה קטנה מהערכים התאורטיים.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
דרך נוספת לחשוב על זה היא שדלתא G בתנאים סטנדרטיים מציג את ההפרש באנרגיה החופשית בין התוצרים למגיבים. כאשר הוא שלילי המשמעות היא שלתוצרים יש אנרגיה חופשית קטנה יותר מלמגיבים ולכן התגובה תמשיך קדימה באופן ספונטני
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
שתי קונבנציות (הנחות שמקובלות ורווחות בקרב הרוב) שצריך להכיר - 1. כשיש תגובה שמגנזיום הוא יון שדרוש ע"מ לתווכה (לרוב תגובות שמערבות ATP) נהוג להניח שריכוז יון המגנזיום הוא 1 מילי מולאר. 2. בתגובות שמערבות מים, יוני מימן או מגנזיום, הריכוזים שלהם לא ייכתבו כחלק מהמשוואה אלא יוגדרו כחלק מהקבועים דלתא G בתנאים סטנדרטיים וטאג או קבוע שיווי המשקל וטאג (שהוא קבוע בתנאים ביוכימיים סטנדרטיים חומציות וריכוז המים מהשאלה הם התוספות )
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ההרכב של מערכת ישתנה עד שהיא תגיע לשוומ. במצב כזה של שוומ ייתכנו עדיין תגובות קדימה ואחורה, אבל הקצב שלהן יהיה זהה ולכן הרכב המערכת יישאר קבוע. קבוע האקוויליביריום (שוומ) שווה לריכוז במולאר (מול לליטר) של כל אחד מהתוצרים בחזקת המקדם הסטוייכומטרי של אותו תוצר חלקי מכפלת ריכוזי המגיבים באותו האופן. כשהמערכת אינה בשוו"מ היא תשאף להגיע לשוומ והתיאור של שאיפה זו הוא דלתא G
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
מערכת איזותרמית היא כזו בעלת טמפ' קבועה ובנוסף גם לחץ קבוע. כיוון שחום יכול להפוך לעבודה רק כשהוא גורר שינוי בטמפ' או בלחץ, לתא חי אין אפשרות לנצל חום לקיומו והוא צריך לנצל אנרגייה חופשית מפירוק של קשרים כימיים בחומרי המזון
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
אם נשליך את המשוואה לחישוב אנרגייה חופשית על תא חי נראה שהוא למשל צורך אנרכיה מהשמש אבל פולט את אותה כמות של אנרגיה בצורת חום לסביבה ומוביל לעלייה באנטרופיה של הסביבה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
היחידות הן ג'אול/ מול* קלווין היא מדד שמבטא את כמות אי הסדר במערכת ההגדרה שמוצגת כאן היא לאנתלפיה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
השינוי באנתלפיה הוא ההפרש בין האנרגיה שהושקעה לשבירת הקשרים הקיימים לאנרגיה שהושקעה לבניית הקשרים החדשים דלתא H גדולה מ- 0 - תגובה אנדותרמית - קליטת חום דלתא H קטנה מ- 0 תגובה אקסותרמית - פולטת חום. היחידות הן ג'אול למול כמו האנרגיה החופשית של גיבס.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
היחידות של גיבס הן ג'אול למול כמו של אנתלפיה אפשר לזכור שכופלים את האנטרופיה בטמפ' ואז הקלווין מתבטל רק של האנטרופיה היחידות הן מה שמוצג בשאלה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
החוק הראשון קובע שאנרגיה איננה נוצרת יש מאין ואיננה נעלמת. ניתן להמיר סוג אחד לאחר ממקום אחד לאחר אך כל האנרגיה ביקום קבוע. יצורים חיים הם למעשה אוסף מסודר מאוד של מולקולות ביחס לסביבה שלהם ובאופן מעניין הם מצליחים לשמור על סדר זה לכאורה בניגוד לחוק השני של התרמודינמיקה. כדי להבין מדוע אין כאן סתירה נגדיר את המושג "מערכת" אותה בוחנים - אוסף של כל החומר שעובר תהליך (כימי או פיזיקלי) בסך הכל המערכת והסביבה שלה מרכיבות את היקום כולם במעבדה מערכת יכולה להיות מבודדת , כלומר כזו שלא מקיימת שום אינטראקציה עם הסביבה לא של החלפת חומר ולא של החלפת אנרגיה. בטבע לעומת זאת המערכת פתוחה והחילוף הוא קבוע. למעשה האינטראקציה הזו עם הסביבה היא מה שמאפשר ליצורים חיים לשמור על רמה מסוימת של סדר בתוכם בלי לסתור את החוק השני של התרמודינמיקה.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כדי לקבוע את קצב הריאקציה הרב שלבית נתייחס לאחד מהשלבים כאילו הוא שלב קובע המהירות - זהו השלב האיטי ביותר. כאשר נדבר על תהליכים ביוכימיים מורכבים נראה כמעט כל תהליך ביוכימי הוא רב שלבי, ולכל מסלול ביוכימי נגדיר את השלבים קובעי המהירות שלרוב יהיו שלבים מבוקרים ביותר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
אם יש יותר משני מגיבים מדובר על ריאקציה רב שלבית. ראשית שני מגיבים יפגשו ויהפכו לתוצר ביניים ראשוני ובשלב השני תתקיים ריאקציה שנייה בה תוצר הביניים של הריאקציה הקודמת יפגוש מגיב שלישי ויהפוך לתוצר המוגמר של הריאקציה הכוללת
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
סדר הריאקציה הינו מושג המתאר כמה ריכוז המגיבים משפיע על קצב הריאקציה. סדר הריאקציה הכולל יהיה חיבור של שתי החזקות
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
הנוסחה לאנרגיית האקטיבציה : Ea=-RTln(k/A) יחס הפוך : ככל שאנרגיית האקטיבצייה גבוהה יותר קצב הריאקציה יורד (K קבוע הריאקציה) גם לריאקציה מאוד ספונטנית יש מחסום אנרגטי המכונה אנרגיית אקטיבציה ככל שהמחסות גבוה יותר הקצב איטי יותר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כלל לה שטלייה קובע כי כל הפרעה לשיווי המשקל לאחר שהריאקציה הגיעה אליו יזכה להתנגדות מצד הריאקציה . כלומר הריאקציה תשאף לחזור לשיווי משקל כימי.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
במצב ייחודי בו ריכוז התוצרים שווה לריכוז המגיבים קבוע שיווי המשקל יהיה שווה ל-0
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ריכוז המגיבים והתוצרים למשל הוא ביחידות של מולאר : מול לליטר
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
חשוב! העובדה שכמות האנרגיה במערכת היא 0 מוחלט לא אומרת שהריאקציה היא סטטית, אלא שנטו אין עדיפות לאף כיוון אבל בכל רגע נתון מתקיימת הריאקציה קדימה ואחורה.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בנוסף, כמעט כל ריאקציה יכולה ללכת לשני הכיוונים
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
הכוונה במועדפות תרמודינמית - החומרים צריכים סיבה להגיב. המרכזית היא ירידה ברמה האנרגטית של החומרים. כלומר התוצרים הם בעלי אנרגיה פנימית נמוכה מהמגיבים ולכן נחשבים יציבים יותר. אנרגיית שפעול - עליהם להיות בעלי אנרגיה מספקת כדי לעבור את המחסום האנרגטי.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
התשובה היא : ככל שקבוע שיווי המשקל גבוה יותר, כך ריכוז התוצרים גבוה יותר ו/או ריכוז המגיבים בשוו"מ נמוך יותר כי חשוב לזכור שבנוסחה עושים ריכוז התוצרים חלקי ריכוז המגיבים
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
במרבית האורגניזמים מולקולות כיראליות קיימות רק בקונפיגורציה כיראלית אחת, למשל ח. אמינו ב- L וגלוקוז ב- D. שיטת ה- RS מצויינת לקביעת קונפיגורציה במולקולות רבות. מנגד כשמסנתזים באופן כימי תרכובות עם פחמן אסימטרי מקבלים תערובת המכילה את כל התצורות האפשריות של הפחמנים הכיראליים, למשל תערובת D ו- L. עם זאת תאים חיים מייצרים רק קונפיגורציה אחת של אותה המולקולה מאחר וגם אנזימים המבצעים את פעולת הסינתזה הינם בעלי מרכזים כיראליים (מורכבים מח. אמינו). חלבונים בכלל ואנזימים בפרט מגלים סטריאוספציפיות גבוהה שזהו אחד המאפיינים המולקולאריים הלוגיים של תאים חיים. אם כן כשאתר קישור של חלבון מתאים לתרכובת עם מרכז כיראלי הוא יזהה קונפיגורציה ספציפית, בדיוק כמו שכפפת יד ימין לא תתאים לשמאל.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
קונפורמציה היא סידור מרחבי
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
בתמונה - מולקולת אתאן במבנה של ball and stick שימו לב כי האנרגייה עולה בקונפורמציית ה- eclipsed המלאה. זה מתקיים בזווית של 0, 120, 240, 360 מעלות. לעומת זאת ביציבה סטאגרד בזווית של 60, 180, 300. חשוב לזכור שההבדלים באנרגיה הם מאוד נמוכים ולכן יש מעבר חופשי בין קונפורמציה אחת לאחרת בתדירות של בערך מיליוני פעמים בשנייה
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
לא ניתן לבודד אף אחת מהקונפורמציות כי הן עוברות מאחת לשנייה בחופשיות, עם זאת כשאח המימנים הקשורים לפחמן במולקולת האתאן (בתמונה) מומר לקבוצה גדולה יותר או טעונה חשמלית הרוטציה החופשית מסביב לקשר פחמן - פחמן נפגעת. מה שמפחית את מספר הקונפורמציות היציבות של נגזרות מולקולת האתאן.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
לגבי העיניין של הסטת האור המקוטב הדבר איננו נכון לגבי כל חומצות האמינו
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
כאשר נרצה להתאים את L- alanine לפי הקונפיגורציה של L-glyceraldehyde נמקם את הקבוצות הכימיות הרלוונטיות הקשורות לפחמן הכיראלי של אלאנין לפי אלו שקשורות לגליצראלדהיד כך שאם ניתן בעזרת ריאקציה כימית חד שלבית להמיר קבוצה הקיימת באלאנין לקבוצה הקיימת בגליצר אלדהיד אז הן תואמות ומתיישרות. כך למשל קבוצת הקרבוקסיל של אלאנין תתפוס את אותה עמדה שתופסת קבוצת הקרבוניל של גליצראלדהיד מאחר וניתן להמיר אלדהיד לקרבוקסיל על ידי ריאקציה חד שלבית של חמצון.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
ל- RNA יש יכולת קטליטית ומבנה סופרה מולקולארי מורכב ל- DNA לא.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0
by Yahav Cohen
Yahav Cohen
1- הפחמן לא ימסור אלקטרונים משום סיבה שהיא כי הוא יאבד יציבות. 2- הפחמן הוא אטום קטן מאוד ופתאום הוא מקבל עוד 4 אלקטרונים שליליים (מטען שלילי רציני לאטום נורא קטן) - הופך למאוד יציב, ולכן מטענים שליליים יהיו על אטומים גדולים כמו יוד וכלור או מולקולות.
לפני 3 שנים
כללי
ביוכימיה - פרק 1 : כימיה כללית
0

QuizMe 2024 © כל הזכויות שמורות. כן, כולן.

מתארחים בגאווה בשרתי Pixis