רמת האוקסין משתנה ודינאמית בצמחים, ולא קבועה. האוקסין פועל יחד עם הציטוקינין בתופעת השלטון הקודקודי, והוא (ולא הציטוקינין) נחשב להורמון החשוב והעיקרי בתופעה. רמת האוקסין בפקעים הצדדיים עולה בבירור לאחר קיטום קודקוד הצמיחה, עקב שבירת עיכוב האוקסין את עצמו.