ביולוגיה מולקולרית ב'

methyl-sequencing מה השיטה אומרת

1

RNA-seq מה השיטה עושה?

1

מה זה next generation sequencing?

1

נכון או לא נכון הכנת ספרייה:

1

שאלה #108565

משתמשים בDNA או RNA שהופכים אותו לDNA

לא משנה האיכות שלו

מחברים את הDNA מהחלקים שהתקבלו בג'ל

מחברים לחלקי הDNA אדפטורים אלא אם זה חלקים קצרים מאוד

איכות הDNA חייבת להיות גבוהה- הבנד שלו בגל חייב להיות ברור כי הNGS רגיש לזה. לDNA עושים פרגמנטציה מפרקים אותו לחתיכות

מיין לפי

מכשיר roche נכון/ לא נכון

1

שאלה #108566

טווח טעות שלהם 20%

סוג טעות היא indels הוספה או החסרת נוקלאוטיד אחד

שימוש עיקרי קליני

אורכי קריאה בין 400-700

טווח טעות 1% שימוש עיקרי לגנומיקה מיקרוביאלית ו meta גנומיקה מיקרוביאלית

נערך לפני שנתיים

מיין לפי

בחר את כל התשובות הנכונות לגבי illumina:

1

סמן את ההיגדים הנכונים לlife technologies SOLiD:

1

סמן את ההיגידים הנכונים לLife technologies Ion torrent& Ion Proton

1

שאלה #108569

		קריאות יותר קצרות מSOLID
		הרצה קצרה בהרבה
		כמות נתונית פחות מסיבית
		משמשת בריצוף קליני או מיקרוביאלי
		מבוסס על סמנים פלורוסנטים

טיפה יותר ארוכות מSOLID מבוסס על הבדלי פוטנציאל בין לוחות וחיבור לdNTP לרצף המשפיע על המתח הזה

נערך לפני שנתיים

מיין לפי

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Pacific Bioscience

1

שאלה #108570

		רצפים ארוכים מאוד( עד 35 אלף בסיסים)
		טווח טעות נמוך של 1.5%
		רוב הקריאות יהיו 15000-20000 בסיסים
		משתמשים בקריאה פלואורוסצנטית של מולקולת DNA אחת שועברת דרך DNA פולימראז

טווח טעות גבוה של 15% ברגע שעוברים נוקלאוטידים שמסומנים בTAG פלואורוסצנטי דרך הDNA פולימראז נחתך הTAG וקורא אותו מכשיר ZMW ולפי הצבע יודעים איזה נוקלאוטים היה (1 מתוך 4 כמובן) רוב הקריאות באיזור 2000 בסיסים אך יש של יותר מ10000

נערך לפני שנתיים

מיין לפי

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Oxford Nanopore Technologies

1

שאלה #108571

		חדשני , נייד מאוד
		מבוסס על מעבר המולקולה דרך פתח זעיר ומדידת השינויים בזרם החשמלי
		לא מדוייק כ-4% טווח שגיאה
		יכול לקרוא ממולקולות קטנות עד מולקולות ענק 100,000 בסיסים
		יקר מאוד

המכשיר די זול וגם הקיטים לא יקרים ממש

מיין לפי

		ריצוף לאחר מתיציה כדי לזהות אם אחרי טיפול מסויים אתר המתילציה משתנה- שינוי זה ישפיע על ביטוי גנים מחלות ועוד
		ריצוף של אקסונים בלבד על מנת למצוא מוטציות שגרמות למחלות, מאפשר למצוא SNP תוספות או חוסרים קטנים.
		שיטה לזיהויי ריצפי RNA ספציפיים במהלך שעתוק
		בעזרת ריצוף הDNA רואים הבדלים בין רצף אינטרון לאקסון בהרכב שלהם

		ריצוף לאחר מתיציה כדי לזהות אם אחרי טיפול מסויים אתר המתילציה משתנה- שינוי זה ישפיע על ביטוי גנים מחלות ועוד
		מעבר המולקולה דרך פתח זעיר ומדידת השינויים בזרם החשמלי
		ריצוף DNA לפי RNA לאחר מתיציה כדי לזהות אם אחרי טיפול מסויים אתר המתילציה משתנה- שינוי זה ישפיע על ביטוי גנים מחלות ועוד
		ריצוף של אקסונים בלבד על מנת למצוא מוטציות שגרמות למחלות, מאפשר למצוא SNP תוספות או חוסרים קטנים.

		שיטת ריצוף כמו סנגר רק טיפה יותר מהירה
		שיטת ריצוף חדשנית אבל שעובדת רק על גנים חדשים
		שיטה מהפכנית לריצוף בעזרת PCR לרוב, שמשמשת הרבה חברות ריצוף היום כל אחת עם הייתרונות והחסרונות שלה
		שיטת ריצוף חדשה ויקרה הרבה יותר ואיטית יותר אך הרבה יותר מדוייקת.

		השיטה הכי נפוצה
		hiseq היא לרצפים ארוכים והרצה ארוכה miseq היא לרצפים קצרים
		miseq היא לרצפים ארוכים והרצה ארוכה hiseq היא לרצפים קצרים
		טווח טעות גבוה מאוד
		קריאה של 100-350 בסיסים
		אין בעיה אם רצפים ארוכים חוזרים
		שימוש באדפטורים אליהם מתחברים רצפי RNA ומכפילים בהדרגה את המקטעים אליהם מוסיפים נוקלטואידים מסומנים פלורוסנטית ואז בכל מחזור יש רצף עם סמן פלורוסנטי ואחר כך מחברים בין המחזורים ואחדים לרצף אחד

		טווח טעות נמוך מאוד
		קריאות ארוכות מאוד
		גילוי מתבצע בעזרת סט פרובים שמתיישבים על הרצף ולפיהם יודעים מה הרצף
		יכול לקרוא משהו חדש DE NOVO

ביולוגיה מולקולרית ב'

Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות

methyl-sequencing מה השיטה אומרת

שאלה #108562

RNA-seq מה השיטה עושה?

שאלה #108563

מה זה next generation sequencing?

שאלה #108564

נכון או לא נכון הכנת ספרייה:

שאלה #108565

מכשיר roche נכון/ לא נכון

שאלה #108566

בחר את כל התשובות הנכונות לגבי illumina:

שאלה #108567

סמן את ההיגדים הנכונים לlife technologies SOLiD:

שאלה #108568

סמן את ההיגידים הנכונים לLife technologies Ion torrent& Ion Proton

שאלה #108569

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Pacific Bioscience

שאלה #108570

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Oxford Nanopore Technologies

שאלה #108571

ביולוגיה מולקולרית ב'

Discuss, Learn and be Happy דיון בשאלות

methyl-sequencing מה השיטה אומרת

RNA-seq מה השיטה עושה?

מה זה next generation sequencing?

נכון או לא נכון הכנת ספרייה:

מכשיר roche נכון/ לא נכון

בחר את כל התשובות הנכונות לגבי illumina:

סמן את ההיגדים הנכונים לlife technologies SOLiD:

סמן את ההיגידים הנכונים לLife technologies Ion torrent& Ion Proton

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Pacific Bioscience

סמן את ההיגידים הנכונים לגבי Oxford Nanopore Technologies

בקשה לשינוי התשובה / תיקון שאלה gavel

בקשה למחיקת השאלהmood_bad

בקשה לשינוי התשובה / תיקון שאלה

בקשה למחיקת השאלה