לפלסמיד יש שני גנים העמידים לשתי אנטיביוטיקות, אמפיצילין וקרימיצין. שמים בפלסמיד מחדר באורך 100 בסיסים בגן של האמפיצילין. על איזה מצע ניתן לגדל את חיידקים כדי לקבל את הפלסמיד ללא המחדר?
ביצענו PCR שמטרתו להגביר גן יחיד בגודל 1000 בסיסים. ביצענו 2 ראקציות PCR זהות, כאשר אחת מהן בוצעה בטמפרטורת annealing גבוהה יותר מהשניה. אחרי ההרצה התקבל הג'ל הבא (ladder – L):
ברצונך לאחות מחדר שנחתך בשתי קצותיו עם EcoRI עם פלסמיד שנחתך גם הוא עם אותו אנזים. אם ברצונך למנוע מצב שהפלסמיד יסגר ללא מחדר במהלך הליגציה יש להשתמש ב: