ההנחה המקובלת כיום היא שאוקסין פועל בשלטון קודקודי באמצעות עיכוב הביוסינתזה של הציטוקינינים, נתמכת ע"י הממצאים ש:

השרשים אינם ממלאים תפקיד מהותי בשמירה על השלטון הקודקודי (קודקוד הצמיחה הוא האיבר העיקרי המעורב בתהליך, בכך שהוא מפריש אוקסין הזורם מטה ומעכב את התפתחות הפקעים הצדדיים). ג' אינו הוכחה, אלא ראיה צדדית שאינה קשורה ישירות לנושא. לעומת זאת, הוכח שקיטום קודקוד הצמיחה מוביל לעליה של רמת הציטוקינין בפקעים הצדדים ולהתפתחותם – הנמנעת כאשר הקודקוד הקטום מטופל באוקסין אקסוגני (הזרימה הבזיפטאלית ממשיכה להתקיים עקב מובילי האוקסין הפולריים).