מטבוליזם של חומצות אמינו סמנו את המשפטים הנכונים השלד הפחמני שנותר בשריר לאחר קטבוליזם של ח"א מסועפות עובר קטבוליזם לגלוקוז בזמן צום קבוצת האמינו של חומצות האמינו המסועפות עוברות טראנסאמינציה ליצירת GLN-גלוטמין, GLU-גלוטמט, ALA-אלאנין, המעבירות את האמוניה לכבד. האחוז הגבוה ביותר מכלל החלבון שעובר שחלוף מתבצע בכבד. חימצון ח"א קטוגניות (Ketogenic Amino Acids) תוביל ליצירת אצטיל COA המהווה חומר מוצא ליצירת גלוקוז הגוף נפטר מהיון {NH}_4 דרך יצירת אוריאה והפרשתה בשתן כ-3% מסה"כ חלבוני הגוף נמצאים בשחלוף יומי (Daily protein turnover)