מולקולת הכלורופיל בנויה מטבעת טטרה-פירולית אליה קשורה שרשרת פיטולית. עירורה של המולקולה על ידי אור כחול מעלה אותה לרמה אנרגטית גבוהה יותר מאשר עירורה על ידי אור אדום