סטודנט במעבדה לחקר צמחים נדרש לשחזר רצפים קדמוניים (reconstruction sequence ancestral (של חלבון Y שפעילותו חשובה לעמידת הצמחים בתנאי העקה. לשם כך בחר הסטודנט מספר מינים של צמחים שידוע לגביהם כי 1( קצב האבולוציה )מספר השינויים המצטברים בגן המקודד לחלבון Y )שונה מאוד בין מין למין; 2( יש מספר לא מבוטל של אירועי הומופלסיה (homoplasy (באבולוציה של הגן. לאור הנתונים הללו הסטודנט החליט להשתמש בשיטת ה- (NJ (Joining Neighbor. מה הייתם ממליצים לאותו סטודנט?