הסיבות העיקריות לכך שמחלת האבעבועות השחורות לא נצפתה בבני אדם ב-30 השנים האחרונות הנן: 1. ביצוע חיסון פעיל כנגד נגיף האבעבועות במרבית בני האדם על פני כדור הארץ 2. בני האד הנם המאכסן (host) היחיד לנגיף האבעבועות השחורות 3. כל בני האדם הרגישים לנגיף האבעבועות השחורות מתו כתוצאה מן המחלה במגפות שהתרחשו בעבר ובני האדם שנשארו בחיים הנם עמידים לנגיף 4. מוטציות טבעיות שהתרחשו בנגיף האבעבועות השחורות הפכו אותו לנגיף שאינו אלים