אחת הבעיות לחישוב נעכלות חלבון כללי במעי הדק הינה אי היכולת למדוד חלבון אנדוגני. אך, בכל זאת רמת הדיוק למתן אומדן נעכלות וספיגה במעי הדק הינה טובה מאוד ברוב המקרים.