מה מהבאים אינו דוגמה למוטיב (suprasecondaarry=fold=motif) מוטיב כולל קיפול של שניים או יותר מבנים שניוניים המחוברים אחד לשני. אלו הם מבנים שיכולים להיות פשוטים יחסית המייצגים מרכיב קטן מתוך החלבון השלם, או מבנים גדולים ומרשימים שמעצבים כמעט את כל מבנה החלבון

ATPase הוא דוגמה לדומיין נפוץ אצל חלבונים רבים דומיין זה אזור או חלק בשרשרת הפוליפפטידית שיציב בפני עצמו ולכן ניתן לנתקו מן החלבון והוא ישמור על המבנה שלו וגם על הפעילות שלו. לדומיין שי פעילות מוגדרת בחלבון והוא מתקפל באופן עצמאי ומכיל בתוכו מוטיבים רבים. אם נחתוך את הדומיין הפעילות של החלבון הכללי תהירס אבל הדומיין ישמור על הפעילות שלו כאנזים. כלומר מדובר על קיפול גלובולארי עצמאי של כל אחד מהדומיינים ו- "חברן" המחבר בין שניהם