חיידקים מסויימים החיים במים מכילים ווקואולות. אפשר להבחין בהם באמצעות מיקרוסקופ אלקטרוני. כל בועית מורכבת מבועית משנה גליליות. צפיפות התאים עולה במקצת על זו של המים והם נוטים לשקוע, על כן יש צורך בבועית המאפשרת התמקמות בשכבת המים הנוחה להם מבחינת ריכוז מקורות המזון, עוצמת אור, ריכוז חמצן וכדומה.