חומצות האמינו נמצאות בעודף גם הן מגיעות לכבד, חוץ מגלוטמאט וגלוטמין אף חומצה אחרת לא יכולה להיכנס למיטוכונדריה שבכבד ולכן שאר חומצות האמינו עוברות טראנסאמינציה לאלפא קטוגלוטרט והופכות לגלוטמאט, כך נקבל את השלדים הפחמניים של חומצות האמינו.