המבנה הגלובולארי של החלבון כולל בתוכו אלפא הליקסים רבים וביניהם אזורים אלפא היקאליים המקשררים - יותר מ- 70 אחוז מח"א במיוגלובין מאורגנות במבנה ל אלפא הליקס
Yahav Cohen0 נקודות ·
יותר מ-6 חודשים
( תגובות)
מוניטין: 1
קבוצת ההם היא אורגנית ובעלת מבנה מישורי המצוי בתוך כיס/ צוואר שנמצא בתוך החלבון. במרכז ההם נמצא יון ברזל שיכול להיות בשני מצבים:
1. Ferrous -דו ערכי ברזל 2 פלוס, גרסה מחוזרת פעילה שמאפשרת קישור של חמצן.
2. Ferric - ברזל 3 פלוס תלת ערכי, גרסה מחומצנת ענייה באלקטרון אחד שאינה פעילה.
מה מהבאים אינו דוגמה למוטיב (suprasecondaarry=fold=motif)
מוטיב כולל קיפול של שניים או יותר מבנים שניוניים המחוברים אחד לשני. אלו הם מבנים שיכולים להיות פשוטים יחסית המייצגים מרכיב קטן מתוך החלבון השלם, או מבנים גדולים ומרשימים שמעצבים כמעט את כל מבנה החלבון
ATPase הוא דוגמה לדומיין נפוץ אצל חלבונים רבים
דומיין זה אזור או חלק בשרשרת הפוליפפטידית שיציב בפני עצמו ולכן ניתן לנתקו מן החלבון והוא ישמור על המבנה שלו וגם על הפעילות שלו. לדומיין שי פעילות מוגדרת בחלבון והוא מתקפל באופן עצמאי ומכיל בתוכו מוטיבים רבים. אם נחתוך את הדומיין הפעילות של החלבון הכללי תהירס אבל הדומיין ישמור על הפעילות שלו כאנזים. כלומר מדובר על קיפול גלובולארי עצמאי של כל אחד מהדומיינים ו- "חברן" המחבר בין שניהם
רוב החלבונים לא מאורגנים או מכילים אזורים שלמים לא מאורגנים. הם לרוב חסרי ליבה הידרופובית ומכילים ריכוז גבוה של חלבונים טעונים ברצף שלהם (למשל ליזין ארגנין וגלוטמאט) שיכולים לשמש כלינקרים וגם כ- scavengers שתפקידם לקשר מולקולות קטנות ויונים ולהשתמש בהם כמאגר. חלק מהחלבונים הללו משמש כחלבוני בקרה - מעכבים חלבונים אחרים במנגנון יוצא דופן - עוטפים את החלבון המבוקר ומונעים את פעילותו - פעולה שמכונה סיקווסטקינג. אחד החלבונים האלו למשל הוא p27 חלבון של מחזור התא שחסר מבנה מסודר ומבצע עטיפה (סיקווסטקינג) לחלבוני מחזור התא ובכך מעכב פעילותם. גידולים סרטניים אנושיים מוצאים דרכים להפחית את רמתם ובכך להחמיר את התוצאה הסופית של המטופלים. ככל שרמתו נמוכה יותר הפרוגנוזה עגומה יותר. חלבון נוסף הוא p53 המכיל אזורים מאורגנים וכאלה שלא, למשל הקצה הקרבוקסילי שלו לא מאורגן ויוצר קשר עם לפחות 4 חלבונים שונים
משפחת השפרונים Hsp70 זו קבוצה של חלבוני עקת חום והם כמעטת תמיד בעלי מסה מולקולרית הקרובה ל- 70 קילו דלתון. נפוצים מאוד בתאים פרוקריוטים ואאוקריוטים ומתבטאים ביתר בזמן עלייה בטמפ'. חלבונים אלה פעילים לרוב כדימרים, נוטים להיקשר לכל הנ"ל פרט ל
חלבוני ה- Hsp70 נמצאים בשני במצבים:
במצב בו החלבונים קושרים ___ - מצב בעל אפיניות נמוכה לאזורים מקופלים - ___
במצב בו החלבונים קושרים ___ - מצב בעל אפיניות גבוהה לאזורים מקופלים - ___